Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPJQ9HC77 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms