Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms