Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms