Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNN2Q99439 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNN2Q99439 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms