Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms