Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms