Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms