Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms