Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FAM71DQ8N9W8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FAM71DQ8N9W8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FAM71DQ8N9W8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FAM71DQ8N9W8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM71DQ8N9W8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM71DQ8N9W8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM71DQ8N9W8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM71DQ8N9W8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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