Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPGRIP1LQ68CZ1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1LQ68CZ1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms