Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms