Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms