Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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