Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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SIX1Q15475 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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SIX1Q15475 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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