Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms