Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms