Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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MKRN4PQ13434 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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MKRN4PQ13434 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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MKRN4PQ13434 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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MKRN4PQ13434 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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MKRN4PQ13434 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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MKRN4PQ13434 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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