Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms