Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms