Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms