Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms