Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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