Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms