Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBP1P32455 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP1P32455 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP1P32455 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms