Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALDH4A1P30038 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALDH4A1P30038 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH4A1P30038 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms