Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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