Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms