Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms