Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEFHP12036 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEFHP12036 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms