Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GMDSO60547 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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