Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB3O43889 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB3O43889 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms