Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFS4O43181 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms