Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGSM2O43147 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGSM2O43147 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms