Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNPHO15079 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNPHO15079 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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SNPHO15079 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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