Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APAF1O14727 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms