Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms