Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM35Q9UPQ4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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