Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms