Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms