Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
REREQ9P2R6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms