Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms