Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRHQ9HD43 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRHQ9HD43 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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