Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms