Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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