Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011290.1-201ENST00000439751 414 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087627.1-201ENST00000522339 993 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354872.2-201ENST00000607679 466 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080080.2-201ENST00000624307 590 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF064858.1-201ENST00000417335 1412 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms