Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms