Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms