Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF496Q96IT1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms