Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM9SF4Q92544 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms