Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CLDN19Q8N6F1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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